این کمیسیون با هدف بهبود و توسعه زیرساخت‌ها، خدمات حمل‌ونقل و ترانزیت کالا، افزایش بهره‌وری و رقابت‌پذیری در این بخش و تسهیل فعالیت‌های لجستیکی، توسعه شبکه‌های جاده‌ای، ریلی، هوایی و دریایی، و همچنین پایانه‌ها و مراکز لجستیکی، افزایش سرعت و دقت در جابجایی کالا، کاهش موانع و بروکراسی در مسیرهای ترانزیتی، و تسهیل تردد کالا از مرزها، ارتقای سطح ایمنی و امنیت در حمل و نقل و ترانزیت کالا و جلوگیری از قاچاق و سایر تخلفات، کاهش آلودگی‌های زیست‌محیطی ناشی از حمل و نقل و ترویج حمل و نقل پایدار فعالیت می‌کند.